L’allocation d'activité partielle est inscrite en comptabilité dès que l’entreprise respecte les conditions de fond et de forme ouvrant droit à cette allocation. Lorsque l’entité reçoit de l’État une allocation couvrant l’indemnité qu’elle verse à son salarié en activité partielle, elle doit l'inscrire au crédit d’un compte de charges de personnel. Il est recommandé de ne pas porter cette allocation en produit exceptionnel. Lorsqu’une entité a déjà reçu une indemnité de cette nature par le passé, elle peut soit continuer à utiliser le même mode de comptabilisation, soit suivre la recommandation de l’ANC, cette dernière devenant alors le nouveau mode de comptabilisation soumis à la permanence des méthodes (ANC, « Recommandations et observations relatives à la prise en compte des conséquences de l’événement Covid-19 dans les comptes et situations établis à compter du 1er janvier 2020 », 18 mai 2020, mise à jour au 8 janvier 2021, rec. J1 et B6A). Ce compte peut être le même que celui dans lequel est comptabilisée l’indemnité versée au salarié (6414), ou un autre compte (6491). Le compte débité en contrepartie pourra être à notre avis le 443 « Opérations particulières avec l'État ». L'opération peut, selon nous, être comptabilisée dès que la prise en charge par l'État est acquise (obtention de l'autorisation) sans qu'il soit nécessaire d'attendre le remboursement effectif par l'État.
L'allocation d'activité partielle de longue durée (APLD) suit, à notre avis, le même traitement comptable.